Shopify vs Medusa: kosten, flexibiliteit en wanneer je welke kiest

Shopify en Medusa worden vaak tegen elkaar afgezet alsof het twee varianten van hetzelfde product zijn. Dat zijn ze niet. Shopify is een gehost SaaS-platform: je huurt een complete winkel, inclusief hosting, checkout en beheer. Medusa is een open-source commerce-engine die je zelf host of onderbrengt bij Medusa Cloud. Daarbovenop bouw je je eigen storefront, vaak in Next.js. Die keuze bepaalt bijna alles: wat je per maand betaalt, wat je zelf kunt aanpassen en wie er verantwoordelijk is als er iets stuk gaat.

Dit artikel vergelijkt de twee op vijf punten: licentie en transactiekosten, apps, hosting, de kosten over drie jaar en flexibiliteit voor B2B, meerdere winkels en meerdere regio's. We sluiten af met de situaties waarin je gewoon bij Shopify moet blijven.

De vergelijking in één tabel

Bronnen: Shopify-prijzen en Medusa-prijzen, beide geraadpleegd op 5 november 2026. Shopify en Medusa noemen hun prijzen in dollars. Omzet en betaalkosten rekenen we in euro's.

Licentie en transactiekosten

Bij Shopify betaal je een vast abonnement. De Nederlandse prijspagina noemt de bedragen in dollars; omgerekend kost Basic circa €35 per maand bij maandbetaling of €26 bij jaarbetaling, Grow circa €94 of €70 en Advanced circa €355 of €266. Shopify Plus begint bij €2.050 per maand. Op de prijspagina van 5 november 2026 staat "vanaf"; het exacte bedrag krijg je via sales.

Het tweede deel van de rekening schaalt met je omzet. Gebruik je Shopify Payments, dan betaal je de kaarttarieven van Shopify. Wil je een eigen betaalprovider, bijvoorbeeld omdat je boekhouding en terugbetalingen al via Mollie lopen, dan rekent Shopify daarbovenop een transactiefee. Die is 2% op Basic, 1% op Grow, 0,6% op Advanced en 0,2% op Plus. Bij een omzet van €1 miljoen per jaar op Advanced is dat €6.000 per jaar, alleen omdat je niet hun betaaldienst gebruikt.

Medusa werkt anders. De broncode staat onder de MIT-licentie, met uitzondering van een aantal Enterprise-onderdelen zoals rollen en rechten (RBAC). Self-hosting kost dus geen licentie. Kies je Medusa Cloud, dan betaal je €26, €88 of €266 per maand voor Develop, Launch of Scale. Medusa schrijft er nadrukkelijk bij: 0% GMV-fee, onbeperkt orders, producten, sales channels, regio's en admin-gebruikers. Je betaalt alleen de transactiekosten van je eigen betaalprovider. Bij Mollie is dat op 5 november 2026 €0,32 per iDEAL-betaling en 1,80% + €0,25 voor consumentenkaarten uit de EER (Mollie-tarieven).

Hoe zwaar dat kan wegen, laat het klantverhaal van Healthletic zien. Volgens Medusa betaalde Healthletic op Shopify Plus €22.300 per maand aan platform- en transactiekosten, bij meer dan €21 miljoen omzet per jaar in zes markten. Na de overstap "verhoogt meer verkopen de platformrekening niet meer" (Medusa: Healthletic). Dat is een grote merchant. Bij €300.000 omzet per jaar is het verschil veel kleiner, en dan wegen de bouwkosten van Medusa zwaarder.

Apps en uitbreidingen

Shopify heeft de grootste app-winkel van de markt. Reviews, abonnementen, bundels, vertalingen: voor bijna elke vraag is er een app, vaak binnen een uur geïnstalleerd. Dat is een echte kracht. Het nadeel zit in de optelsom. Elke app is een los abonnement met een eigen prijsmodel, en sommige rekenen per order. Na een paar jaar betalen veel merchants meer aan apps dan aan Shopify zelf. Wat dat bij jou is, lees je af aan je eigen facturen. Een eerlijke vergelijking begint met dat totaalbedrag.

Medusa heeft minder plugins, en dat moet je niet wegpraten. Wat er wel is: een modulaire kern met commerce-modules voor onder meer prijzen, promoties, voorraad, fulfilment, regio's, sales channels en belasting (Medusa-documentatie). Wat ontbreekt, bouw je als eigen module of workflow. Dat kost eenmalig ontwikkeltijd in plaats van een maandelijkse fee, en de logica staat in je eigen code.

Hosting en beheer

Bij Shopify hoef je niet na te denken over servers, beveiligingsupdates of piekverkeer. Dat is inbegrepen, en voor de meeste kleine en middelgrote winkels is dat het sterkste argument voor Shopify.

Bij Medusa kies je. Je host zelf, bijvoorbeeld een Node.js-server met Postgres, of je gebruikt Medusa Cloud. Medusa Cloud regelt infrastructuur, previews en schaalbaarheid. Volgens Medusa zit er geen lock-in aan: je kunt later naar self-hosting. De storefront draait meestal apart, bijvoorbeeld op Vercel. Dat geeft vrijheid, maar het betekent ook dat iemand die stack bewaakt. Zonder ontwikkelaar of bureau is Medusa geen goed idee. Hoe wij dat onderhoud inrichten, staat bij Medusa onderhoud en support.

Wat kost het over drie jaar?

Een voorbeeld met alleen de gepubliceerde prijzen. De omzet is €1 miljoen per jaar en je gebruikt een eigen betaalprovider. Apps, bouw en onderhoud staan er niet in, omdat die per project verschillen.

Op platformkosten wint Medusa dit voorbeeld ruim. Maar het voorbeeld is onvolledig: een Medusa-shop moet gebouwd worden. Een storefront, een checkout, koppelingen met ERP of WMS en het testen daarvan kosten in het begin flink meer dan een Shopify-thema met apps. Daarna betaal je doorlopend voor onderhoud. De vuistregel: hoe hoger je omzet en hoe meer apps je nu betaalt, hoe eerder Medusa goedkoper wordt. Bij een kleine omzet met standaardproducten is Shopify over drie jaar bijna altijd goedkoper.

Flexibiliteit: B2B, meerdere winkels en regio's

Hier zit het grootste inhoudelijke verschil. Shopify heeft B2B-functies, maar op de gewone plannen tot drie B2B-catalogi. Onbeperkt kan alleen op Plus. Ook een uitgebreid aangepaste checkout is een Plus-functie, en op de gewone plannen krijg je één headless storefront tegenover 25 op Plus (Shopify-prijzen). Wie B2B, meerdere merken en eigen checkoutregels wil, komt bij Shopify dus al snel bij het Plus-tarief uit.

Bij Medusa horen regio's, valuta, sales channels, klantgroepen en prijslijsten bij de kern. Je bouwt een B2B-portaal met offertes, bedrijfsaccounts en goedkeuringsstromen op dezelfde engine als de consumentenshop. Medusa onderhoudt daarvoor een officiële B2B-starter onder MIT-licentie. Meer daarover staat bij onze dienst Medusa B2B-webshop.

De klantverhalen van Medusa laten zien waar het bij Shopify-merchants knelde:

• Eight Sleep startte in 2017 op Shopify. Volgens Medusa werden "hoge kosten en beperkte controle over de backend een bottleneck" bij meer dan tien 3PL's en meer dan dertig markten. De migratie verliep gefaseerd, te beginnen bij fulfilment, en was binnen vier maanden klaar (Medusa: Eight Sleep).
• Hooch verkoopt bedrukte blikjes aan zakelijke klanten. Op Shopify konden ze alleen standaardproducten aanbieden; maatwerkorders liepen via mail en telefoon. "Met Shopify hadden we vaak developers nodig, zelfs voor kleine aanpassingen", zegt hun webdesigner. De nieuwe B2B-shop met configurator ging binnen twee weken live (Medusa: Hooch).
• Healthletic verhuisde gefaseerd van Shopify Plus. Oude abonnementen en fulfilment bleven via een sync-plugin tijdelijk in Shopify. Medusa meldt een ongeveer 30% hogere checkoutconversie in de eerste maand (Medusa: Healthletic).

Dit zijn verhalen die Medusa zelf publiceert, met de cijfers van Medusa en die klanten. Het zijn geen projecten van Alpha Digital. Wij gebruiken ze als illustratie, niet als belofte.

Wanneer kies je wel Shopify?

Shopify is de betere keuze als:

• je snel live wilt en geen eigen ontwikkelaar of bureau voor de lange termijn hebt;
• je assortiment overzichtelijk is en je B2C verkoopt zonder bijzondere prijsregels;
• je omzet onder de grens ligt waarop omzetfees en apps zwaar gaan tellen;
• je de Shopify-checkout en Shop Pay als voordeel ziet en niet als beperking;
• je een kassasysteem in de winkel wilt koppelen zonder eigen werk.

In die situaties is Medusa vooral duurder en trager. Dat zeggen we ook in een kennismaking.

Wanneer kies je Medusa?

Medusa past als:

• je B2B en B2C op één systeem wilt, met eigen prijsafspraken per klant;
• je meerdere winkels, merken of landen vanuit één backend wilt beheren;
• je checkout, orderflow of fulfilment afwijkt van wat een standaardplatform toestaat;
• je omzetfees en app-abonnementen inmiddels een duidelijke kostenpost zijn;
• je de code en data zelf wilt bezitten en later van hosting wilt kunnen wisselen.

Twijfel je, begin dan bij de vraag welke processen nu buiten de shop leven: in spreadsheets, mailtjes of losse apps. Die lijst bepaalt de keuze meer dan het platform. De overstap zelf beschrijven we in Overstappen naar Medusa. Andere vergelijkingen: WooCommerce vs Medusa, Magento vs Medusa, PrestaShop vs Medusa en Lightspeed vs Medusa.

Waar Medusa niet de beste keuze is

Eerlijk is eerlijk:

• Ecosysteem. Er zijn minder kant-en-klare plugins dan bij Shopify. Een nieuwe functie is vaker ontwikkelwerk dan een klik.
• Eigen verantwoordelijkheid. Hosting, updates en monitoring liggen bij jou of je bureau, ook met Medusa Cloud voor de backend.
• Startkosten. Een goed gebouwde Medusa-shop kost aan het begin meer dan een Shopify-thema.
• Enterprise-functies. RBAC, SSO en audit logs vallen onder Medusa Enterprise, en daarvoor betaal je apart.

Een Medusa-webshop laten bouwen?

Wil je weten wat het voor jouw shop betekent? Op Medusa-webshop laten maken staat hoe wij een nieuwe shop bouwen, en bij Migreren naar Medusa hoe we een Shopify-shop overzetten zonder verkeer te verliezen. Laat je terugbellen of plan een kennismaking.

Bronnen

Dollarbedragen uit de bronnen zijn omgerekend naar euro tegen de ECB-koers van 5 november 2026 (1 euro = 1,1224 dollar) en afgerond.